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	<title>Andreas und Guidos Tagebuch</title>
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		<title>Alles hat ein Ende …</title>
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		<pubDate>Fri, 19 Feb 2010 12:05:33 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
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		<description><![CDATA[20 Wochen sind vergangen und das Praktikum nun offiziell beendet.
Ich musste eine wissenschaftliche Arbeit über das Praktikum schreiben. Darin stellt man das Thema vor, präsentiert seine Ergebnisse und muss diese diskutieren. Ich habe zwar schon 2 solche Arbeiten in kleinerem Format geschrieben, aber das war kein Vergleich zu dieser. Das Thema ist ziemlich komplex und [...]]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<p>20 Wochen sind vergangen und das Praktikum nun offiziell beendet.<br />
Ich musste eine wissenschaftliche Arbeit über das Praktikum schreiben. Darin stellt man das Thema vor, präsentiert seine Ergebnisse und muss diese diskutieren. Ich habe zwar schon 2 solche Arbeiten in kleinerem Format geschrieben, aber das war kein Vergleich zu dieser. Das Thema ist ziemlich komplex und es gibt so viele verschiedene Wege und Möglichkeiten wie verschiedene Proteine oder sonst was interagieren.  Na ja aber irgendwie hab ich mich da durch gewurschtelt und am Montag hab ich die Arbeit dann abgegeben. In 3 Wochen beginnt das neue Semester und dann muss ich diese Arbeit verteidigen. Dabei muss ich eine power point Präsentation ausarbeiten und so meine Arbeit 3 anwesenden Professoren und  sonstigen Interessierten vorstellen und beschreiben was ich da die ganze Zeit gemacht habe.  Danach können die Profs und auch alle anderen Fragen stellen und mich in die Enge treiben (das ist deren Spezialität <img src='http://www.mint-individual.de/blog/wp-includes/images/smilies/icon_wink.gif' alt=';)' class='wp-smiley' />  ) Und am Ende bekomm ich dann eine Note, die für das ganze Semester zählt. Also die setzt sich aus dem Gutachten meines Betreuers in Halle (der gibt mir da schon eine Note), der Beurteilung meines Betreuers in Senftenberg und der Leistung bei der Verteidigung zusammen.  Na mal sehen wie das so wird…<br />
Auf jeden Fall hat im Labor in der letzten Woche doch noch alles halbwegs geklappt. Aber es war echt so stressig, wie die ganze Zeit nicht. Ich musste teilweise so zeitig aufstehen, dass ich mir selbst so unheimlich leid tat, dass es echt nicht mehr schön war. Aber ich hatte das Ende ja schon vor Augen und hab mir immer gesagt, dass ich dann erstmal ordentlich ausschlafen werde, wenn ich nicht mehr nach Halle fahren muss.<br />
Jetzt ist zwar so von den Versuchen her alles fertig, aber ich stelle nun alle Ergebnisse ordentlich und halbwegs übersichtlich zusammen und arbeite die Präsentation aus, damit ich in Halle schon mal den Vortrag probeweise halten kann und die dort alle Ergebnisse von mir haben, um zu überlegen, wie es nun weiter geht und welche Versuche folgen werden.<br />
Es ist immer schwierig und prinzipiell haben die Versuche schon ein wenig Aufschluss gebracht und verschiedenen Unklarheiten etwas erleuchtet, aber es ist nicht so einfach, dass auf Allgemeines zu beziehen. Auch wenn die Zellen von dem gleichen Gewebe sind, sind die doch, je von welchem Patienten die entnommen werden, total verschieden und verhalten sich auch anders. Obwohl das theoretisch gar nicht s wirklich möglich ist. Aber die machen einfach was sie wollen. Frechheit!<br />
Und daher geht die Forschung weiter und man wird sich noch ewig mit den komischen Zellen rumschlagen müssen <img src='http://www.mint-individual.de/blog/wp-includes/images/smilies/icon_smile.gif' alt=':)' class='wp-smiley' /><br />
Aber bei mir läufts nun erstmal ein bissl ruhiger und ich freu mich mir das vormittags-TV-Programm zu Gemüte führen zu können und schön abzugammeln. Aber damit die gehaltslosen Serien nicht auch meine Gehirnleistung auf ein Minimum reduzieren,  kümmere ich mich natürlich nebenbei darum meine Präsentation für die Verteidigung zu entwerfen, mein Laborbuch und meine Dateien für das Labor zu ordnen und mich um eine Stelle für die Bachelor-Arbeit zu bewerben. Es wird halt nie langweilig… </p>
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		<title>Die letzte Woche ist angebrochen.</title>
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		<pubDate>Mon, 01 Feb 2010 20:13:13 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
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		<description><![CDATA[Heute ist der letzte Montag, den ich offiziell im Labor gearbeitet habe. Ja ja die Zeit rast langhin und mir ein wenig davon.
Im letzten Eintrag hab ich ja geschrieben, dass ich nun die ganzen real time PCRs nochmal machen muss. Und da bin ich auch grad ordentlich dran und krieg mittlerweile schon ne kleine Krise, [...]]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<p>Heute ist der letzte Montag, den ich offiziell im Labor gearbeitet habe. Ja ja die Zeit rast langhin und mir ein wenig davon.<br />
Im letzten Eintrag hab ich ja geschrieben, dass ich nun die ganzen real time PCRs nochmal machen muss. Und da bin ich auch grad ordentlich dran und krieg mittlerweile schon ne kleine Krise, wenn ich das ganze Zubehör zu dieser PCR sehe. Um so ein Ding anzusetzen muss man ein Haufen Zeugs zusammen pipettieren. Immer wieder klitzekleine Gefäße befüllen und das immer wieder in der gleichen Reihenfolge und immer wieder 72 Proben und immer wieder von 1 bis 72 zählen … ja ich sags ja … da wird man verrückt.<br />
Na ja aber es gibt eine gute und – wie immer – natürlich auch eine schlechte Nachricht. Zuerst die Gute: das momentan schon verhasste Protein wurde erfolgreich blockiert. Also hat sich der Samstag im Labor gelohnt, was schon mal sehr erfreulich ist. Die schlechte Nachricht ist jedoch, dass ich eine neue Substanz benutze, die nun dummer Weise auf manche Gene nicht wirkt und die real time PCR nicht funktioniert. Also wurde dann letzte Woche noch ganz fix eine andere Substanz bestellt, die heute angekommen ist. Leider ist der erste Versuch mit dem neuen Zeug fehlgeschlagen und hat wieder nicht das Ergebnis gebracht, was eigentlich hätte da sein müssen. Die Frage ist jetzt, ob ich mich einfach nur vermacht hab beim immer wieder von 1 bis 72 zählen und so oder ob es jetz immer noch nicht geht. Da ja meine letzte Woche schon am Laufen ist, muss einfach die erste Methode zutreffen. Ich hoffe es. Na ja und durch dieses Problem ist nun mal wieder ein Haufen Zeit drauf gegangen, weil ich nun das eine Gen schon zum vierten Mal in die real time PCR schicke. Und das ist mittlerweile so nervig. Man man man … aber das schaff ich jetzt die letzte Woche auch noch.<br />
Wenn ich nichts weiter mehr zu tun hätte, wäre das ja theoretisch auch nicht so das Problem, aber ich muss auch noch die Zellzyklusanalyse machen und das mit 40 Proben. Da sitze ich an der Sterilwerkbank und die ganze Arbeitsfläche ist voll mit kleinen Petrischalen. Da ist Organisation mal wieder alles. Bisher ist auch jede Behandlung ohne Verwechslungen oder andere unangenehme Zwischenfälle verlaufen. Ich hoffe natürlich, dass das auch bis zum Schluss so bleibt und der Versuch erfolgreich von Statten geht …</p>
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		<title>Fotos</title>
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		<pubDate>Sun, 17 Jan 2010 16:52:36 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
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		<description><![CDATA[Ich hatte nun auch mal die Möglichkeit ein paar Bilder von mir zu machen. Und da hab ich mal ein paar ausgesucht. So könnt ihr euch vielleicht mal ein kleines Bildchen machen, wie es im Pathologie-Labor in Halle so zugeht ^^.
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			<content:encoded><![CDATA[<p>Ich hatte nun auch mal die Möglichkeit ein paar Bilder von mir zu machen. Und da hab ich mal ein paar ausgesucht. So könnt ihr euch vielleicht mal ein kleines Bildchen machen, wie es im Pathologie-Labor in Halle so zugeht ^^.</p>
<div id="attachment_44" class="wp-caption alignnone" style="width: 235px"><img class="size-medium wp-image-44" src="http://www.mint-individual.de/blog/wp-content/uploads/2010/01/DSC000031-225x300.jpg" alt="Um zu kontrollieren, ob die Zellen auch schön fleißig gewachsen sind, schau ich mir diese unterm Mikroskop an." width="225" height="300" /><p class="wp-caption-text">Um zu kontrollieren, ob die Zellen auch schön fleißig gewachsen sind, schau ich mir diese unterm Mikroskop an.</p></div>
<div id="attachment_45" class="wp-caption alignnone" style="width: 310px"><img class="size-medium wp-image-45" src="http://www.mint-individual.de/blog/wp-content/uploads/2010/01/DSC00015-300x225.jpg" alt="Hier isoliere ich RNA. Dafür hab ich die Zellen vorher in diesen 6-well-Platten wachsen lassen und entnehme die jetzt und ubertrage die auf diese Röhrchen (die da noch rumstehen) für weitere Arbeitsschritte." width="300" height="225" /><p class="wp-caption-text">Hier isoliere ich RNA. Dafür hab ich die Zellen vorher in diesen 6-well-Platten wachsen lassen und entnehme die jetzt und ubertrage die auf diese Röhrchen (die da noch rumstehen) für weitere Arbeitsschritte.</p></div>
<div id="attachment_46" class="wp-caption alignnone" style="width: 310px"><img class="size-medium wp-image-46" src="http://www.mint-individual.de/blog/wp-content/uploads/2010/01/DSC00019-300x225.jpg" alt="Nachdem ich die Röhrchen mit den Zellen befüllt hab werden die zenrtifugiert, damit sich die Zellen von dem Medium (diese pinke Flüssigkeit) absetzten und ein Pellet bilden." width="300" height="225" /><p class="wp-caption-text">Nachdem ich die Röhrchen mit den Zellen befüllt hab werden die zenrtifugiert, damit sich die Zellen von dem Medium (diese pinke Flüssigkeit) absetzten und ein Pellet bilden.</p></div>
<div id="attachment_47" class="wp-caption alignnone" style="width: 310px"><img class="size-medium wp-image-47 " src="http://www.mint-individual.de/blog/wp-content/uploads/2010/01/DSC00028-300x225.jpg" alt="Dem Pellet (sieht man hier nicht, weil das so klein ist) geb ich dann beta-Mercaptoethanol zu." width="300" height="225" /><p class="wp-caption-text">Dem Pellet (sieht man hier nicht, weil das so klein ist) geb ich dann beta-Mercaptoethanol zu.</p></div>
<div id="attachment_48" class="wp-caption alignnone" style="width: 235px"><img class="size-medium wp-image-48 " src="http://www.mint-individual.de/blog/wp-content/uploads/2010/01/DSC00036-225x300.jpg" alt="Die RNA-Lösungen pipettier ich dann mehr oder weniger nach einer Arbeitsvorschrift immer wieder auf mit verschiedenen Waschlösungen und Reagenzien zusammen." width="225" height="300" /><p class="wp-caption-text">Die RNA-Lösungen pipettier ich dann mehr oder weniger nach einer Arbeitsvorschrift immer wieder auf mit verschiedenen Waschlösungen und Reagenzien zusammen.</p></div>
<div id="attachment_49" class="wp-caption alignnone" style="width: 235px"><img class="size-medium wp-image-49 " src="http://www.mint-individual.de/blog/wp-content/uploads/2010/01/DSC00044-225x300.jpg" alt="Mit einem Photometer wird dann die RNA-Konzentration gemessen. Dafür pipettier ich die nun fertige RNA-Lösung in eine Küvette, die ich dann ins Photpmeter stelle wo mit einer bestimmten Wellenlänge RNA-Moleküle gemessen werden." width="225" height="300" /><p class="wp-caption-text">Mit einem Photometer wird dann die RNA-Konzentration gemessen. Dafür pipettier ich die nun fertige RNA-Lösung in eine Küvette, die ich dann ins Photpmeter stelle wo mit einer bestimmten Wellenlänge RNA-Moleküle gemessen werden.</p></div>
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		<title>Samstags ins Labor – was man nicht alles tut ;-)</title>
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		<pubDate>Sun, 17 Jan 2010 16:31:23 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
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		<description><![CDATA[Wie ich beim letzten Eintrag geschrieben hatte, hab ich diese Woche den Westernblot gemacht. Ich wollte ja wissen, ob ich bei den letzten Versuchen das Protein wirklich blockiert hatte. Das macht man übrigens mit einer siRNA. Denn wie ihr vielleicht wisst wird ja bei der Transkription DNA in RNA umgeschrieben. Und bei der folgenden Translation [...]]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<p>Wie ich beim letzten Eintrag geschrieben hatte, hab ich diese Woche den Westernblot gemacht. Ich wollte ja wissen, ob ich bei den letzten Versuchen das Protein wirklich blockiert hatte. Das macht man übrigens mit einer siRNA. Denn wie ihr vielleicht wisst wird ja bei der Transkription DNA in RNA umgeschrieben. Und bei der folgenden Translation die mRNA in Protein umgewandelt. Und wenn ich eben diese mRNA blockiere kann folglich auch das Protein nicht gebildet werden. Die siRNA lagert sich an die mRNA an und so kann die bei der Translation nicht abgelesen werden und auch das Protein nicht gebildet werden.<br />
Na ja lange Rede, kurzer Sinn hat die siRNA wohl die letzten Male nicht so richtig funktioniert und die mRNA in der Zelle nicht genug blockiert. Also war dann immer noch Protein in der Zelle, das eigentlich nicht mehr da sein sollte. Das ist dann natürlich doof und ich kann bestimmte Effekte nicht beobachten und es ist so ziemlich alles unbrauchbar. Im Westernblot hat sich das also leider bestätigt und die verfluchte siRNA war wohl irgendwie kaputt.<br />
Also hab ich diese Woche nachdem ich den Westernblot gemacht hatte, neue Zellen eingestreut, die ich dann wieder behandeln kann. Leider kam dann erst am Donnerstag die siRNA und ich konnte dann erst am Freitag nach 24h die RNA isolieren und dann am Samstag nach 48h. Weil die RNA schreibe ich dann in cDNA um und mit der mach ich dann die real time PCRs. Und wenn dieses verflixte Protein dann wieder nicht blockiert wurde und sich da fröhlich auf meinen Grafiken rumtummelt, dann knallt die Bombe. Aber das wollen wir ja alle nicht, also hoffe ich mal ganz stark, dass jetzt mal alles macht was es soll <br />
Hinzu kommt dann nochmal schön Zellzyklus-Analyse. Da mach ich nochmal einen Versuch. Beim letzten Mal waren zu wenig Zellen messbar. Und jetzt mach ich ein bissl was anders beim Versuchsablauf. Mal gucken was das soweit bringt.<br />
Wir werden es erleben &#8230;</p>
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		<title>erst mal wieder warm werden</title>
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		<pubDate>Sun, 10 Jan 2010 16:20:48 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
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		<description><![CDATA[Nun ist die Winterpause auch schon wieder vorbei. Über Weihnachten und Silvester hatte ich frei und hab ein weinig für meine Arbeit gemacht, die ich ja über das Praktikum schreiben muss.
Als am 4.1. die Arbeit wieder los ging mussten wir erst mal wieder reinfinden. Man muss sich einen Plan machen und sich überlegen, wie es [...]]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<p>Nun ist die Winterpause auch schon wieder vorbei. Über Weihnachten und Silvester hatte ich frei und hab ein weinig für meine Arbeit gemacht, die ich ja über das Praktikum schreiben muss.<br />
Als am 4.1. die Arbeit wieder los ging mussten wir erst mal wieder reinfinden. Man muss sich einen Plan machen und sich überlegen, wie es weiter geht. Die Zellen, an denen wir die Versuche durchführen, waren über die Feiertage eingefroren, da sonst jeden Tag jemand ins Labor hätte fahren müssen, um sie mit neuem Medium zu füttern und die Zellen auf neue Kulturgefäße zu verteilen, wenn diese zu dicht gewachsen waren. Also werden die in einer bestimmten Lösung ins Gefrierfach gelegt und dann halten die es dort ziemlich lange aus.<br />
Naja vor Weihnachten ist mir noch was ziemlich dummes aufgefallen. Ich hatte alle real time PCRs gemacht. Dabei gibt man der DNA-Probe verschiedene Primer zu. Die lagern sich an die DNA an und so werden immer wieder neue Kopien von den jeweiligen DNA-Strängen gemacht. Und je nach Primer kann man eben verschiedene DNA-Stücke vervielfältigen lassen. So kann man bestimmte Proteine untersuchen. Und dabei ist mir aufgefallen, dass 2 Proteine nicht auf eine Behandlung angesprochen haben. Ich habe in bestimmten Zellen ein Protein blockiert, dass dieses von der Zelle nicht mehr gebildet wird und  in den real time PCRs konnte ich aber keinen Abfall dieses Proteins sehen. Nun ist es wahrscheinlich, dass die Methode das Protein zu blockieren nicht funktioniert hat. Das ist mal wieder nicht so gut, weil dann wieder ein Haufen Arbeit und Zeit für nichts war. Und eigentlich kann ich mir sowas grad nicht mehr leisten, weil die Zeit nun wirklich langsam drängt und die ganze Versuchsreihe zu wiederholen wäre zu zeitaufwendig um das in meiner Zeit jetzt noch zu schaffen. Nun hab ich erstmal einen Versuch angesetzt und wieder Zellen bearbeitet, in denen ich das Protein blockiert hab. Aus den Zellen hab ich Protein isoliert und nun werde ich in dieser Woche gucken, ob ich im Westernblot nun endlich mal den Effekt sehen kann das blöde Protein jetz auch weg ist. Und wenn das nicht funktioniert , dann liegt es wohl am Material (also das irgendein Reagenz nicht das getan hat, was es soll) oder ich hab irgendetwas falsch gemacht. Aber das wird sich zeigen.<br />
Ich weiß nicht was schlimmer sein sollte. Auch wenn es am Material liegt, kann ich mir davon nicht wirklich was kaufen, weil der Versuch dann trotzdem für meine Arbeit nicht brauchbar ist.<br />
Also wird die nächste Woche wieder spannend. Hoffentlich kann ich mit dem Versuch was erreichen und bin hinterher schlauer. Wie auch immer das Ergebnis ausfällt …</p>
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		<title>Nächste Woche wird’s nochmal stressig!</title>
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		<pubDate>Sat, 12 Dec 2009 15:37:29 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
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		<description><![CDATA[Irgendwie war es die vergangene Woche relativ ruhig für mich. Ich konnte keinen Westernblot machen, weil ein Antikörper nachbestellt werden musste und real time PCRs konnte ich auch nicht machen, weil ich dafür erstmal neue RNA isolieren muss. Was mir aber sehr entgegen kam, weil ich ein wenig krank war und daher keine Probleme mit [...]]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<p>Irgendwie war es die vergangene Woche relativ ruhig für mich. Ich konnte keinen Westernblot machen, weil ein Antikörper nachbestellt werden musste und real time PCRs konnte ich auch nicht machen, weil ich dafür erstmal neue RNA isolieren muss. Was mir aber sehr entgegen kam, weil ich ein wenig krank war und daher keine Probleme mit nem unstressigen Tag hatte. In der Woche waren „nur“ Triplex assays und Zellzahlmessungen angesagt. Die Zellen werden für beide Methoden verschieden behandelt (also wieder knock-downs von bestimmten Genen und Behandlung mit einem Chemotherapeutikum). Dann werden die Zellen gezählt, um mal richtig Zahlen zu haben, wie die Zellzahl abnimmt mit der Behandlung. Man sieht das zwar unterm Mikroskop aber so hat man es mal schwarz auf weiß und Daten mit denen man arbeiten kann.  Ein Triplex assay ist ein Verfahren, wo den Zellen Substrate zugegeben werden. Das sind jeweils 3 verschiedene. Jeweils ein Substrat wird von lebenden, toten und apoptotischen Zellen verarbeitet. Diese Substrate können dann bei bestimmten Wellenlängen von einem Gerät erkannt werden, dass dann die Absorption angibt. Somit weiß ich dann wie bestimmte Zelllinien auf die Behandlungen reagieren. Also wie viele nach bestimmten Zeiten noch leben und welche schon abgestorben sind und welche apoptotisch zu Grunde gehen.<br />
Diesen assay wollte ich dann letzte Woche für 2 Zelllinien machen, aber die eine ist nicht richtig gewachsen. In den Kulturschalen wird eine bestimmte Anzahl von Zellen gegeben und dort können die dann wachsen. Und manchmal machen die das ganz gut und manchmal eben nicht. Und somit konnte ich nur für die eine Zelllinie den Triplex assay machen.<br />
Dafür kommt die andere Zelllinie dann aber natürlich nächste Woche. Und auch die RNA-Isolation, die ich machen muss, um real time PCRs machen zu können. Das wird ganz schön viel, aber wenn alles glatt geht ist das zu schaffen…</p>
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		<title>So, jetz steht der Plan.</title>
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		<pubDate>Fri, 04 Dec 2009 15:36:06 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
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		<description><![CDATA[In der letzten Woche hab ich es endlich fertig gebracht alle Westernblots zusammenzutragen und bei der wöchentlichen Besprechung dem Chef zu zeigen. Deswegen war die Woche auch ziemlich stressig. Immerhin waren es bis dahin 28 Blots. Und diese Woche hatte ich noch die letzten paar für das eine Protein gemacht. Von diesem hat bisher der [...]]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<p>In der letzten Woche hab ich es endlich fertig gebracht alle Westernblots zusammenzutragen und bei der wöchentlichen Besprechung dem Chef zu zeigen. Deswegen war die Woche auch ziemlich stressig. Immerhin waren es bis dahin 28 Blots. Und diese Woche hatte ich noch die letzten paar für das eine Protein gemacht. Von diesem hat bisher der Antikörper gefehlt und irgendwie ist da bei der Firma was falsch gelaufen und deshalb durfte ich jetzt 6 Wochen auf den Antikörper warten. Und wie es so schön ist funktioniert der jetzt nicht mal richtig und wir müssen wahrscheinlich noch einen von einer anderen Firma bestellen.<br />
Aber na ja, das war dann endlich mal der Anlass die Zelllinien auf besondere Effekte oder Auffälligkeiten zu überprüfen. Und dabei ist auch etwas rausgekommen. Ein Protein nimmt bei verschiedenen knock-downs (also ausschlaten) von wieder anderen Proteinen zu. Und dieses Protein ist in meinem Fall für Apoptose der Zellen zuständig. Apoptose nennt man den sogenannten Selbstmord der Zelle. Die Zelle wird von verschiedenen Faktoren als verändert oder mutiert erkannt (also so zum Beispiel wenn ich das Chemotherapeutikum dazu gebe) und dann gibt es Proteine die in dieser „kranken“ Zelle die Apoptose aktivieren. Dabei zerfällt die Zelle in einzelne Zellteile, um sich nicht mehr weiter vermehren zu können und ist somit zerstört. Na ja und ich werd jetzt noch bis zum Ende diesen Effekt durch andere Experimente bestätigen und noch ein paar schöne Daten bekommen.<br />
So konnten wir jetzt endlcih mal einen genauen Plan machen, was jetzt bis zum Ende des Praktikums noch gemacht werden soll und ich hab endlich was worauf ich aufbauen kann. Ja und diese Untersuchungen stehen in den nächsten Wochen an. Dabei hoffe ich sehr, dass dieser erkannte Effekt auch befürwortet werden kann. Es kann ja auch sein, dass die Westernblots nicht sehr eindeutig oder einfach nur Zufall sind. Das wäre natürlich dementsprechend schlecht und deswegen denke ich einfach mal nicht an diese Situation <img src='http://www.mint-individual.de/blog/wp-includes/images/smilies/icon_smile.gif' alt=':-)' class='wp-smiley' />   </p>
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		<title>Nach Wochen mal wieder Erfolg.</title>
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		<pubDate>Wed, 18 Nov 2009 19:56:28 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
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		<description><![CDATA[Hallo ,
heute hat der Westernblot das erste Mal seit Wochen wieder geklappt. Nachdem die letzte Woche eine war in der ich auch im Bett hätte bleiben können, war heute neue Motivation in Anflug. Ich hatte ja als letztes berichtet, dass die Membranen der Schlüssel zu all dem Unheil waren und ich naiv dachte, jetzt kann [...]]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<p>Hallo ,<br />
heute hat der Westernblot das erste Mal seit Wochen wieder geklappt. Nachdem die letzte Woche eine war in der ich auch im Bett hätte bleiben können, war heute neue Motivation in Anflug. Ich hatte ja als letztes berichtet, dass die Membranen der Schlüssel zu all dem Unheil waren und ich naiv dachte, jetzt kann ja nichts mehr kommen. Aber ich hätte es besser wissen müssen. Die Milch, die verwendet wird um die Membran zu „blocken“, war schlecht und hat daher seine Aufgabe nicht erfüllen können. Die Milchmoleküle binden an die Membran wo kein Protein ist. Sonst würde nach dem entwickeln auf dem Film alles schwarz sein. Die Phase des Entwickelns der Filme, wo bestenfalls die Proteine in Form von „Banden“  auftauchen sollen (kennt man auch Serien wo DNA dargestellt wird, um den Mörder zu finden oder so ^^ -nur da heißt es Southernblot- und so ist das beim Westernblot mit Proteinen) ist immer die spannendste. Weil diese Phase über die vergangenen 2 Tage Arbeit entscheidet. Entweder hat sie sich gelohnt oder –woran ich mich schon fast gewöhnt hab- Pech gehabt, alles war umsonst, die Bilder nicht verwendbar. Nun bin ich dabei die Proteine ins beste Licht zu rücken, quasi. Ich muss die Membranen mit den Proteinen so oft waschen und wieder neu mit der Entwicklerlösung behandeln und belichten bis die Banden am besten sichtbar sind. Aber das ist das kleinste Übel nach all dem … ich sags jetz lieber nicht.<br />
Ansonsten ist Alltag im Labor angesagt und nichts weiter zu erzählen. Wir haben Institutsseminarre und Laborseminare, wo jeder seine Abreiten der Woche dem Chef vorträgt oder eben vor der gesamten Institusmitarbeiterschaft Vorträge gehalten werden oder so. Dann war am Dienstag ein Vertreter von einer Firma da und hat ein gerät vorgestellt. Was natürlich alles ganz fix gehen sollte und am Ende bei ner Vortragszeit von 3 Stunden endete – Super <img src='http://www.mint-individual.de/blog/wp-includes/images/smilies/icon_wink.gif' alt=';-)' class='wp-smiley' />  Aber der Mann war glücklich das wir ale so schön zugehört haben. Besser als nichts!</p>
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		<title>Die Membranen waren es! / Schweinegrippe</title>
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		<pubDate>Fri, 06 Nov 2009 21:08:25 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
				<category><![CDATA[Andrea]]></category>

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		<description><![CDATA[Schönen guten Abend,
es ist kaum zu glauben, aber ich habe heute einen Westernblot entwickelt, den ich diesmal mit anderen Membranen gemacht habe. Das Gel in dem man die Proteine auftrennt wird dann auf eine Membran übertragen. Das geschieht mit Strom. Die Ladung der Proteine wird ausgenutzt, damit sie von dem Gel auf die Membran geblottet [...]]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<p>Schönen guten Abend,<br />
es ist kaum zu glauben, aber ich habe heute einen Westernblot entwickelt, den ich diesmal mit anderen Membranen gemacht habe. Das Gel in dem man die Proteine auftrennt wird dann auf eine Membran übertragen. Das geschieht mit Strom. Die Ladung der Proteine wird ausgenutzt, damit sie von dem Gel auf die Membran geblottet werden. Und an diese Membran kann man dann Antikörper binden lassen, welche dann den Ort de Proteine nach dem Entwickeln sichtbar machen. Na ja und höchstwahrscheinlich lag das ganze Westernblot-Desaster nun letztendlich an den Membranen. Das war jetzt auch wirklich die letzte Möglichkeit, die noch bestand. Denn eine andere Apparatur, andere Antikörper und alles Mögliche hatte ich schon einmal ausprobiert. Die letzte Option waren also nun die verflixten Membranen. Und ich bin vielleicht erleichtert, dass endlich die Ursache gefunden ist. Also ich mein, ich muss trotzdem so gut wie alles nochmal machen, aber besser als noch Wochen auf das Gerät von Methode 1 zu warten was zur Reparatur ist. Ja doch ich freu mich <img src='http://www.mint-individual.de/blog/wp-includes/images/smilies/icon_smile.gif' alt=':-)' class='wp-smiley' /><br />
So und Thema 2 meiner  Überschrift hängt sicherlich alles schon zum Halse raus, aber ich hab mir am Donnerstag die Schweinegrippenschutzimpfung verpassen lassen. Die haben das in der Uni angeboten. Eigentlich wollte ich ja nicht, aber dann hab ich erfahren, dass man nicht immun ist, wenn man einmal infiziert wurde (das war ja so mein Plan: ich geh auf Risiko und entweder hab ich Glück und hab die Grippe nicht, oder mir geht’s halt mal 1 Woche schlecht). Also ist impfen schon ne gute Alternative, grad weil ich ja zur Zeit so viel Zug fahren (nach Halle jeden Tag eine Stunde hin und zurück)  Angst hatte ich aber trotzdem. In den Medien wird das Thema so zerkaut und eigentlich weiß man nicht mehr was man glauben kann und was nicht. Und es kam ja immer so rüber, als würde sonst was Gefährliches in dem Impfstoff sein, was noch Monate und Jahre später Folgen haben könnte. Dann hab ich mal ein wenig rumgefragt und rumgegooglet und am Ende kam heraus, dass in dem Impfstoff auch nur die Inhaltsstoffe sind, wie auch in jeder anderen Grippeschutzimpfung. Die Verstärker wie man so schön sagt sind zwar nicht toll, aber halt immer enthalten…Na ja und so bin ich dann hin zum Betriebsarzt und die Spritze selbst war überhaupt nicht schlimm. Es hat ziemlich gedrückt, war aber durchaus auszuhalten. Den ganzen Tag über ging es mir gut und abends so halb 10 fingen meine Beine und mein Rücken an weh zu tun und da dachte ich schon-komisch so schnell kann das doch noch gar nicht kommen (weil man sagt ja 1,5 bis 2 Tage nach der Impfung treten Nebenwirkungen auf). Dann kam Fieber dazu und ich hab ne Schmerztablette genommen um einschlafen zu können. Die Nacht war dann ziemlich bescheiden, weil man sich halt elend fühlt und am nächsten Tag (sprich heute) war ich noch schlapp und müde. Jetzt ist es abends und mir geht’s wieder wunderbar. Nur mein Arm ist dick und blau. Ganz schön krasses Zeugs. Jetzt noch 2 Wochen warten und dann können mich die Viren mal-dann bin ich immun! <img src='http://www.mint-individual.de/blog/wp-includes/images/smilies/icon_smile.gif' alt=':-)' class='wp-smiley' /> </p>
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		<title>Methode 2 macht auch schlapp &#8211; die sind doch alle gegen mich!</title>
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		<pubDate>Tue, 03 Nov 2009 19:41:44 +0000</pubDate>
		<dc:creator>Andrea</dc:creator>
				<category><![CDATA[Andrea]]></category>

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		<description><![CDATA[Hallöchen,
die Westernblots drehen weiter ihre Runden und auch die zweite Methode macht nun Probleme. Ach man es ist zum verrückt werden. Die Banden auf den Membranen sollten ja eigentlich schön definiert und klar abgrenzbar sein, aber diese sind nach dem blotten irgendwie verwischt und somit nicht reprasentativ und somit nicht zu gebrauchen. Super! Langsam vergess [...]]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<p>Hallöchen,<br />
die Westernblots drehen weiter ihre Runden und auch die zweite Methode macht nun Probleme. Ach man es ist zum verrückt werden. Die Banden auf den Membranen sollten ja eigentlich schön definiert und klar abgrenzbar sein, aber diese sind nach dem blotten irgendwie verwischt und somit nicht reprasentativ und somit nicht zu gebrauchen. Super! Langsam vergess ich das Gute in diesen Geräten. Na ja jetz hab ich eine Reihe von hässlichen Blots zusammengestellt und eine Art Beschwerde an die Firma des Blot-Gerätes geschickt. Die sollen jetzt mal erzählen ob die sich das erklären können oder ob die einen Tipp haben um sowas zu vermeiden. Aber ärgerlich ist es mittlerweile wirklich. Immer wieder das gleiche zu machen ist ja nicht so schlimm, weil eine gewisse Grundspannung ist ja immer dabei. Man will ja wissen was bei raus kommt-also so eine Art Überraschungsei <img src='http://www.mint-individual.de/blog/wp-includes/images/smilies/icon_smile.gif' alt=':-)' class='wp-smiley' /> . Und dann am Ende kommt nichts raus. Also nicht mal was gutes oder was schlechtes, sonder gar nichts, weil das alles nicht zu gebrauchen ist. Jetzt hab ich auch schon etliche Varianten ausprobiert, mit unterschiedlichen Filtern und Membranen und mit einer ganz anderen. Heute hab ichs noch einmal mit einer anderen Apparatur probiert. Da bin ich gespannt was morgen als Ergebnis erscheint.<br />
Und dann muss ich mal schauen was ich die Woche über noch so mache &#8211; neben den heißgeliebten Westernblots natürlich. Anne und Rebeca fahren nämlich Mittwoch und Donnerstag zu einer bekannten Biotech Firma und informieren sich dort über ein Verfahren welches sich real time PCR nennt. Eine PCR ist eine Methode um DNA zu vervielfältigen. So kann man auch mit kleinsten DNA-Resten was anfangen, wenn man diese eben „kopiert“. So hat man mehr davon und kann verschiedene Untersuchungen durchführen. Und real time bedeutet dabei, dass man zeitgetreu die Vervielfältigung verfolgen kann über eine Sonde, die die DNA-Menge bestimmt und gleichzeitig an einen PC weiterleitet an dem man dann Sekunde für Sekunde an einem Graphen sehen kann wie viel DNA schon gemacht wurde. Da gibt es aber derzeit noch eine Unstimmigkeit und somit weiß ich nun nicht ob ich die PCRs schon machen soll oder lieber abwarte bis die beiden vom Kongress zurück sind. Da die Zeit drängt werd ich die PCRs wohl trotzdem schon machen. Mal sehen ob die klappen, wenn nicht mach ichs halt ncohmal…darin bin ich ja mittlerweile gut <img src='http://www.mint-individual.de/blog/wp-includes/images/smilies/icon_wink.gif' alt=';-)' class='wp-smiley' />  </p>
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